Сражаясь со злым гением Энимо, Бен не стал прислушиваться к советам кузины Гвен и дедушки Макса, поэтому был полностью поглощен зловещей световой энергией. Как оказалось, во время схватки было активировано самоуничтожение Оминитрикса. Сигнал об этом достиг Тетракса Шарда и тот отправился к Бену, ведь самоуничтожение Омитрикса грозит гибелью не только Бену, но и всей галактике. Остановить процесс под силу лишь изобретателю часов Азимусу. Поэтому юный защитник Земли вместе с Тетраксом и кузиной Гвен отправляются на поиски ученного.
Так как им неизвестно где находится Азимус героям предстоят долгие поиски по всей вселенной. Но не стоит забывать и о Вилгахе и его воинах, они ни на шаг не отстают от Бена и его команды втягивая их в новые бои.